74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4420 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  53.36 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  56.81 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  51.92 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  54.23 
 
 		 303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  53.57 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  49.65 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  56.6 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  55.25 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  51.4 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  47.39 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  54.74 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  46.92 
 
 		 369 aa  255  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  48.59 
 
 		 399 aa  255  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  48.94 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  48.24 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  55.36 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  46.92 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  47.26 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  47.26 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  46.92 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  47.89 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  47.75 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  58.75 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  54.28 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  53.66 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  57.94 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  48.36 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  48.36 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  48.36 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  48.8 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  58.23 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  48.62 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  50.17 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  47.2 
 
 		 299 aa  221  9e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  54.82 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  43.37 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  46.12 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  50.61 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  43.15 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  42.26 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  45.99 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  44.58 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  41.49 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  45 
 
 		 324 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  44.58 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  45 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  44.67 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  39.26 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  50.81 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  158  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  42.8 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  38.93 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  40.32 
 
 		 250 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  42.73 
 
 		 312 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  36.33 
 
 		 498 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  39.02 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  42.6 
 
 		 253 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  35.56 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  49.6 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  41.77 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  35.89 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  26.7 
 
 		 250 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  22.08 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  25.85 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.17 
 
 		 270 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  31.18 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  30.05 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1412  hypothetical protein  27.69 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  25.29 
 
 		 1209 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  40.35 
 
 		 119 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  25.53 
 
 		 256 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  31.37 
 
 		 268 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  26.49 
 
 		 264 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>