92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0567 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  100 
 
 		 338 aa  665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  51 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  43.88 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  42.22 
 
 		 364 aa  242  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  43.06 
 
 		 295 aa  235  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  45.22 
 
 		 392 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  46.98 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  35.88 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  47.01 
 
 		 246 aa  199  6e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  45.3 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  41.35 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  39.75 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  43.16 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  40.95 
 
 		 262 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  45.22 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  40.78 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  34.95 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  41.41 
 
 		 239 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  38.39 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  41.22 
 
 		 255 aa  169  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  37.05 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  36.15 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  36.54 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  36.64 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  36.64 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  37.6 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  37.2 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  37.2 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  36.4 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  37.6 
 
 		 299 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  36.4 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  36.4 
 
 		 300 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  38.25 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  38.67 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  35.52 
 
 		 288 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  36.65 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  37.8 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  37.8 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  37.8 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  42.92 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  37.6 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  33.88 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  36.25 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  38.7 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  31.62 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  36.99 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  36.14 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  36.25 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  35.68 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  34.35 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  35.91 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  35.08 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  33.19 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  35.89 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  28.96 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  28.42 
 
 		 223 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  26.21 
 
 		 256 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  27.94 
 
 		 256 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  26.21 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  27.53 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  26.72 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  26.8 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  26.8 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  26.8 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  26.8 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  31.09 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  26.8 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  26.8 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  33.01 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  32.58 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  31.07 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  30.25 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  30.25 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  30.25 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  30.25 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  25.57 
 
 		 254 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  26.13 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.84 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  24.42 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  30.25 
 
 		 255 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  28.66 
 
 		 264 aa  42.7  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>