64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0237 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 335 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  51.19 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  55.64 
 
 		 293 aa  297  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  57.89 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  47.73 
 
 		 392 aa  248  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  43.28 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  47.66 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  49.03 
 
 		 246 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  45.76 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  52.85 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  41.44 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  49.62 
 
 		 300 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  42.04 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  49.4 
 
 		 239 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  44.92 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  43.02 
 
 		 498 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  43.66 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  43.12 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  42.28 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  41.91 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  43.51 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  43.13 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  43.51 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  42.75 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  42.75 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  42.75 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  43.35 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  43.6 
 
 		 243 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  42 
 
 		 255 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  49.62 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  42.69 
 
 		 243 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  41.06 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  50.77 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  41.34 
 
 		 250 aa  182  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  43.49 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  42.41 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  43.13 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  39.85 
 
 		 258 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  42.34 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  41.54 
 
 		 257 aa  172  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  40.86 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  42.11 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  41.89 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  42.32 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  42.32 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  42.32 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  42.42 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  38.02 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  39.04 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  40.3 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  42.8 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  41.51 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  40.38 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  40.77 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  42.17 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  44.7 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  42.11 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  39.43 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  40.6 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  38.93 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  38.35 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  25.12 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  23.98 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>