73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1700 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
355 aa  703    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  56.93 
 
 
392 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  51.21 
 
 
293 aa  252  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  45.23 
 
 
312 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  53.15 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  46.67 
 
 
498 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  47.39 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  48.1 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  50.6 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  46.88 
 
 
335 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  51.21 
 
 
324 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  52.54 
 
 
239 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  50.63 
 
 
325 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  48.96 
 
 
300 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  35.99 
 
 
338 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  40.69 
 
 
253 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  43.27 
 
 
262 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  43.44 
 
 
255 aa  182  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  41.6 
 
 
336 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  41.6 
 
 
399 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  41.6 
 
 
369 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  41.6 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  41.2 
 
 
300 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  42 
 
 
300 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  40.8 
 
 
399 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  40.8 
 
 
300 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  40.8 
 
 
300 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  40.8 
 
 
300 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  47.3 
 
 
305 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  41.6 
 
 
243 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  41.34 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  39.68 
 
 
299 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  41.2 
 
 
243 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 
250 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
294 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  48.13 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  39.2 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  38.25 
 
 
258 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  40.8 
 
 
301 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  38.78 
 
 
303 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  36.61 
 
 
299 aa  155  8e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  38.8 
 
 
295 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  37.2 
 
 
257 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  42.25 
 
 
319 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  39.75 
 
 
317 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  40.91 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  36.36 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  40.38 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  40.4 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  36.86 
 
 
312 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  36.86 
 
 
312 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  36.86 
 
 
312 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  37.21 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  36.61 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  39.52 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  38.33 
 
 
321 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  39.51 
 
 
312 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  36.78 
 
 
293 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  38.22 
 
 
298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  40.64 
 
 
319 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  39.02 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  28.78 
 
 
263 aa  49.7  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  28.02 
 
 
263 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0205  hypothetical protein  26.15 
 
 
264 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  23.85 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  21.59 
 
 
307 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  23.69 
 
 
315 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  23.85 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  24.76 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  26.37 
 
 
343 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 
265 aa  43.1  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  25.6 
 
 
250 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>