78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2611 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
392 aa  789    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  56.93 
 
 
355 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  50.36 
 
 
312 aa  282  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  55.51 
 
 
293 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  51.44 
 
 
498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  49.81 
 
 
295 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  53.28 
 
 
364 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  46.53 
 
 
246 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  49.01 
 
 
325 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  47.73 
 
 
335 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  47.37 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  45.16 
 
 
325 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  47.08 
 
 
300 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  47.32 
 
 
253 aa  216  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  47.26 
 
 
239 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  45.22 
 
 
338 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  41.56 
 
 
243 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  40.4 
 
 
262 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  47.08 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  44.67 
 
 
255 aa  190  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  43.88 
 
 
399 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  40.83 
 
 
243 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  43.46 
 
 
369 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  43.46 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  42.28 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  41.87 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  43.46 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  42.62 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  41.87 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  41.46 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  41.87 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  40.08 
 
 
299 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  41.8 
 
 
294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  42.62 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  41 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  43.7 
 
 
255 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  46.67 
 
 
305 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  40.32 
 
 
258 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  39.34 
 
 
299 aa  167  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  38.15 
 
 
257 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 
301 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  39.26 
 
 
303 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  40.76 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 
319 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  38.27 
 
 
320 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  39.24 
 
 
333 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  40.66 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  40.39 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  40.16 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  37.2 
 
 
312 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  37.2 
 
 
312 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  37.2 
 
 
312 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  42.74 
 
 
298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 
319 aa  130  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  39.11 
 
 
311 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  36.95 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  39.17 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  41.49 
 
 
298 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  39.24 
 
 
312 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 
319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  39.52 
 
 
315 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  24.21 
 
 
250 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  23.42 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1631  protein of unknown function DUF81  24.08 
 
 
237 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000001538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  25.25 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3844  hypothetical protein  25.68 
 
 
266 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  24.58 
 
 
257 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  23.92 
 
 
265 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  24.15 
 
 
257 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  28.73 
 
 
274 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  24.15 
 
 
257 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  23.97 
 
 
256 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  24.38 
 
 
256 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  25.62 
 
 
256 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  25.62 
 
 
256 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  25.62 
 
 
256 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  25.62 
 
 
256 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>