80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2466 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
293 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  62.77 
 
 
295 aa  318  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  53.72 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  55.51 
 
 
392 aa  267  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  55.34 
 
 
364 aa  265  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  51.21 
 
 
355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  52.05 
 
 
338 aa  251  9.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  53.31 
 
 
246 aa  248  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  55.56 
 
 
312 aa  245  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  56.09 
 
 
300 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  49.11 
 
 
253 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  47.16 
 
 
324 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  50.85 
 
 
325 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  50.21 
 
 
239 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  48.94 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  47.64 
 
 
255 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  46.64 
 
 
262 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  44.26 
 
 
498 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  55.84 
 
 
305 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  47.37 
 
 
299 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  46.61 
 
 
399 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  47.54 
 
 
300 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  47.54 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  47.54 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  46.22 
 
 
399 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  47.54 
 
 
336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  45.08 
 
 
243 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  47.13 
 
 
300 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  45.9 
 
 
300 aa  198  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  47.13 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  47.13 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  46.91 
 
 
258 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  45.57 
 
 
243 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  50.38 
 
 
305 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  44.94 
 
 
294 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  43.27 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  45.93 
 
 
301 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  42.5 
 
 
299 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  41.56 
 
 
257 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  45 
 
 
255 aa  173  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 
250 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  40.5 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  44.73 
 
 
312 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  44.73 
 
 
312 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  44.73 
 
 
312 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  38.11 
 
 
295 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  41.94 
 
 
324 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  43.93 
 
 
304 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  43.75 
 
 
311 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  40.16 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  42.11 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  41.94 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  43.2 
 
 
307 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  43.15 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  42.8 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  39.42 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  41.87 
 
 
312 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  39.08 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  44.53 
 
 
315 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  40.65 
 
 
319 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  36.89 
 
 
319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  25.65 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0060  hypothetical protein  24.38 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  26.58 
 
 
254 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  30.26 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  30.26 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  25.4 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  27.14 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.36 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  26.92 
 
 
256 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  27.14 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  26.63 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  27.14 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  27.14 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  27.14 
 
 
256 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  25.45 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  23.11 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  26.97 
 
 
268 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  26.5 
 
 
256 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>