83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2187 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  48.79 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  49.45 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  48.76 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  48.41 
 
 		 300 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  48.41 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  48.32 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  48.06 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  48.06 
 
 		 300 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  48.41 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  48.06 
 
 		 399 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  47.7 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  48.06 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  47.35 
 
 		 369 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  42.52 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  44.62 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  42.47 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  41.05 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  41.05 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  41.05 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  39.87 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  41.34 
 
 		 295 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  44.32 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  45.71 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  46.61 
 
 		 324 aa  195  7e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  39.34 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  44.6 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  43.11 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  44.32 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  42.57 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  40.71 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  45.76 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  42.5 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  41.16 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  42.91 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  42.05 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  47.06 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  46.22 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  42.07 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  40.98 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 		 392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  42.67 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  41.91 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  40.86 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  40.96 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  39.08 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  40.56 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  39.68 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  36.61 
 
 		 355 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  43.83 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  45.34 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  43.83 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  39.84 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  42.08 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  41.27 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  40.66 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  38.25 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  37.3 
 
 		 250 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  44.68 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  38.52 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  32.68 
 
 		 498 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  27.2 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  28.11 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  27.19 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  26.27 
 
 		 259 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  26.17 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  26.77 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  29.23 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.65 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  25.36 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  27.23 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  26.17 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  27.23 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  29.27 
 
 		 243 aa  46.6  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  24.47 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  27.68 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  22.89 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  24.43 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.05 
 
 		 273 aa  43.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  28.69 
 
 		 267 aa  42.7  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>