More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1487 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  461  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  51.27 
 
 
241 aa  246  3e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  54.17 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  50.42 
 
 
241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  39.84 
 
 
247 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  36.18 
 
 
251 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  37.04 
 
 
253 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  37.45 
 
 
252 aa  149  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  35.39 
 
 
253 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  36.13 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  36.13 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  37.19 
 
 
256 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 
252 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  35.19 
 
 
250 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  29.17 
 
 
253 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  27.92 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  29.75 
 
 
253 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 
247 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 
247 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  27.23 
 
 
257 aa  99.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  28.7 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  28.78 
 
 
239 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  27.92 
 
 
253 aa  99  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  98.2  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  28.15 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  28.15 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  30.54 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  28.15 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  28.15 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  28.93 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  30.13 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 
251 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  27.71 
 
 
251 aa  93.2  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  26.81 
 
 
257 aa  93.6  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  26.42 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  27.27 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  26.69 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  27.71 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  26.78 
 
 
257 aa  92  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  29.83 
 
 
259 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  30.67 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  25.21 
 
 
280 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  26.92 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  25.64 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  29.83 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  30.59 
 
 
255 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  26.61 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  26.78 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  28.98 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  28.98 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  27.71 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  30.25 
 
 
256 aa  89  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  28.82 
 
 
267 aa  89  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  28.98 
 
 
256 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  25.74 
 
 
259 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  25.74 
 
 
259 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  26.89 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  25.32 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  25.11 
 
 
264 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  26.61 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  25.33 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  26.09 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  27.85 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  25.85 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  30.04 
 
 
259 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  27.43 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  28.57 
 
 
269 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  30.7 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  28.51 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  26.81 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  28.15 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  27.39 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  32.1 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  27.85 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  30.86 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  32.1 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  22.84 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  28.99 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  32.1 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  29.82 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  29.29 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  26.41 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  26.41 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>