More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0440 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  49.59 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  45.27 
 
 
251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  40.76 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  40.34 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  37.19 
 
 
243 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 
252 aa  148  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 
250 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  39.26 
 
 
253 aa  141  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  33.19 
 
 
245 aa  139  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  36.4 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  37.39 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  32.79 
 
 
252 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  32.79 
 
 
252 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  37.4 
 
 
269 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  37.4 
 
 
269 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  38.21 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  37.35 
 
 
256 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  36.59 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  35.77 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  36.95 
 
 
256 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  36.95 
 
 
256 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  36.95 
 
 
256 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  29.54 
 
 
259 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  36.22 
 
 
259 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  35.66 
 
 
268 aa  102  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  31.33 
 
 
259 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  33.86 
 
 
267 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  31.11 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  31.17 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  31.17 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  31.17 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  30.36 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  34.01 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  29.46 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  29.29 
 
 
257 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  35.04 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  29.88 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  32.93 
 
 
259 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  30.89 
 
 
266 aa  95.5  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  95.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  29.6 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  31.2 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  26.27 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  36.9 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  26.27 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  30.34 
 
 
251 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  30.67 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  31.84 
 
 
251 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  33.47 
 
 
253 aa  94  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  30.67 
 
 
247 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  26.27 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  29.71 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  30.45 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  30.74 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  31.97 
 
 
267 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  28.06 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  29.57 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  28.74 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  26.94 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  33.46 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  30.27 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  26.53 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  29.69 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  30.37 
 
 
239 aa  89  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  27.56 
 
 
259 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  29.5 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  30.27 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  30.86 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  30.86 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  28.98 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  29.89 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  29.75 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  30.34 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  29.89 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  30.49 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  29.89 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  29.89 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  29.89 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  30.45 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  30.45 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  27.27 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  28.03 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  27.8 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  30.45 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  31.67 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  33.96 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  31.7 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  24.68 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  27.46 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  31.87 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  28.34 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  26.92 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>