More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0600 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  463  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  54.17 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  43.57 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  43.57 
 
 
241 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  36.18 
 
 
247 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  37.7 
 
 
253 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  34.96 
 
 
253 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  34.98 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  33.61 
 
 
252 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 
252 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  32.49 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  32.7 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  31.34 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  32.42 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  31.96 
 
 
247 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  30.67 
 
 
270 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  29.13 
 
 
270 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  28.87 
 
 
257 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  31.11 
 
 
253 aa  103  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 
250 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  31.74 
 
 
257 aa  102  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  30.34 
 
 
267 aa  101  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  31.09 
 
 
269 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  30.67 
 
 
253 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  31.54 
 
 
259 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  30.67 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  30.67 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  30.67 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  28.94 
 
 
257 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  30.67 
 
 
269 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  30.83 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  31 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  31 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  31 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  31 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  30.42 
 
 
256 aa  99  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  30.42 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  30.42 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  28.51 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  26.47 
 
 
257 aa  96.7  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  30.47 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  28.22 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  26.14 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  26.8 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  27.53 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  29.63 
 
 
254 aa  92  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  30.65 
 
 
250 aa  92  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  26.51 
 
 
261 aa  92  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  27.13 
 
 
256 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  26.29 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  31.51 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  26.47 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  27.8 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  31.09 
 
 
269 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  30.25 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  30.47 
 
 
256 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  27.73 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  27.94 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  28.33 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  27.04 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  27.43 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  27.04 
 
 
251 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  26.89 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  27.43 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  30.18 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  28.19 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  27.39 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  27.04 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  22.67 
 
 
260 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  22.67 
 
 
260 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  22.67 
 
 
255 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 
261 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
266 aa  85.9  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  28.93 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  29.95 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  25.32 
 
 
257 aa  85.1  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  27.05 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  29.95 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  24.59 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  23.72 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  29.95 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  29.49 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  29.49 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  29.49 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  29.49 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  29.49 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  24.51 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>