More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0541 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  95.85 
 
 		 241 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  51.27 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  43.57 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  43.15 
 
 		 247 aa  194  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  45.23 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  40.34 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  35.24 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  36.82 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  36.24 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  35.63 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  35.5 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  36.67 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  36.67 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  29.74 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  30.36 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  32.63 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  28.09 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  32.34 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  30.04 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  28.05 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  29.26 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  27.16 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  27.16 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  27.16 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  27.16 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  31.44 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  27.83 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  27.07 
 
 		 270 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  26.75 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  31.36 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  29.26 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  32.08 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  30.84 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  26.79 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  31.8 
 
 		 223 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  27.83 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  30.91 
 
 		 256 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  30.88 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  30.45 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  26.09 
 
 		 259 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  30.45 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  26.48 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  26.09 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  30.45 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  30.45 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  29.52 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  27.43 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  30.26 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  30.26 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  25.22 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  33.05 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  28.82 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  30.45 
 
 		 269 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  30.45 
 
 		 269 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  30.7 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  31.69 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  27.31 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  30.26 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  27.35 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  25.21 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  29.82 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  26.84 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  29.82 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  28.95 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  31.72 
 
 		 260 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  25.86 
 
 		 252 aa  85.5  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  29.74 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  28.03 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  31.65 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  31.65 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  31.22 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  31.51 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  31.51 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  30.42 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  26.84 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  29.36 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  25.75 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  26.67 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>