More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3013 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  43.27 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  45.23 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  43.57 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  45.27 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  36.18 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  42.13 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  42.61 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  34.98 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  36.55 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  36.55 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  37.08 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  38.3 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  40.87 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  34.01 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  32.73 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  33.62 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  32.75 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  33.19 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  28.46 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  28.39 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  31.23 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04790  predicted permease  30.67 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.542879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  32.24 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  31.58 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  28.45 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  27.05 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  33.06 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  31.14 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  25.79 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  30.83 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  33.47 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  29.79 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  26.25 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  26 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  29.36 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  31.08 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  28.83 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  28.83 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  31.17 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  31.17 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  32.08 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  28.05 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  31.6 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  32.92 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  25.3 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  25.75 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  27.31 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  27.17 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  29.06 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  31.03 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  26.05 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  29.36 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  28.34 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  27.08 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  26.45 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  26.91 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  26.38 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  29.24 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  29.24 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  29.24 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  25.98 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  29.06 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  28.81 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  30.43 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  31.67 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  26.56 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  30.26 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  28.63 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  28.63 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  26.94 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  32.1 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  26.38 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  26.75 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  25.59 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  26.83 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  27.49 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1011  hypothetical protein  32.72 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  26.83 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  28.09 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  28.81 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>