252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1038 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  473  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  68.15 
 
 		 251 aa  321  6e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  70.56 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  57.38 
 
 		 258 aa  269  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  59.11 
 
 		 253 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  60.82 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  57.09 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  57.14 
 
 		 249 aa  248  6e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  51.61 
 
 		 251 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  50.4 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  51.61 
 
 		 257 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  56.33 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  52.02 
 
 		 257 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  44.21 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  43.55 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  43.95 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  44.13 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  29.8 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  29.8 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  29.8 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  30.49 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  30.45 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  32.16 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  32 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  31.6 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  32.61 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  32.1 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  27.71 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  32.1 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  25.82 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  26.4 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  32.26 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  29.22 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  27.57 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  27.69 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  26 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  27.69 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  27.69 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  30.13 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  26.75 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  27.69 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  28.86 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  28 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  26.86 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  26.25 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  26.03 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  30.24 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  26.03 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  29.15 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  32.26 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  25.2 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  30.93 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  26.86 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  31.62 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  30.93 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  26.53 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  30.96 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  30.96 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  30.54 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  31.65 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  31.08 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  30.29 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  27.73 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  30.09 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  30 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01556  hypothetical protein  27.64 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  26.86 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  29.55 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  30.36 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  26.52 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  31.17 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  26.51 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  29.18 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  25.69 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  26.64 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  27.38 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  30.13 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  28.81 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  29.22 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  26.23 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  26.45 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  25.68 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  27.35 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  28.51 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  27.43 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  24.79 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  23.87 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>