214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1898 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  67.35 
 
 		 251 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  66.8 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  57.71 
 
 		 258 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  60.82 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  56.85 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  57.55 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  55.6 
 
 		 253 aa  238  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  52.85 
 
 		 263 aa  238  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  50.81 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  57.31 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  52.19 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  46.06 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  52.19 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  45.85 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  47.2 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  43.87 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  31.28 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  32.1 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  32.1 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  32.1 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  32.11 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  32.65 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  29.26 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  29.57 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  28.95 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  27.87 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  28.21 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  29.71 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  27.46 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  30.47 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  29.69 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  31.6 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  27.71 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  28.98 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  30.8 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  28.98 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  27.85 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  27.2 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  28.86 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  24.49 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  28.51 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  30.61 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  31.47 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  28.46 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  27.07 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  29.74 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.32 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  29.22 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  27.24 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  25.31 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  27.73 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  27.24 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  25.31 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  24.49 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  26.78 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  27.24 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  27.24 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  27.24 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  27.24 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  27.71 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  25.71 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  26.86 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  28.46 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  25.91 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  28.39 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  28.81 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  30.58 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  25.45 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  26.09 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  29.67 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  29.33 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  29.18 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  26.83 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  26.83 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  28.06 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  28.4 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  28.35 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  27.16 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  29.96 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  25.62 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  29.96 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  25.62 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  26.92 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  25.62 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  25.62 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  25.62 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  25.62 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>