252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2628 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  100 
 
 		 253 aa  485  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  60.32 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  60.17 
 
 		 251 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  57.09 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  50.81 
 
 		 258 aa  243  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  55.87 
 
 		 253 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  57.55 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  50.61 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  54.03 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  50.61 
 
 		 263 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  48.81 
 
 		 257 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  52.82 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  47.62 
 
 		 257 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  44.08 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  43.72 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  44.94 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  42.11 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  30.52 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  31.49 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  30.65 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  30.65 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  30.65 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  29.15 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  30.86 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  32.37 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  32.37 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  33.91 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  30.47 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  32.37 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  29.48 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  25.51 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  29.48 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  29.76 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  28.8 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  27.78 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  29.07 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  27.13 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  29.92 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  33.77 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  30.47 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  31.17 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  28.69 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  29.22 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  32.26 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  29.62 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  27 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.69 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  27.95 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  28.23 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  28.75 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  27.46 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  33.85 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  26.94 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  26.94 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  26.94 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  29.34 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  29.44 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  26.94 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  27.35 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  26.94 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  31.47 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  27.95 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  27.6 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  27.75 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  26.58 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  29.1 
 
 		 266 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  29.22 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  30.17 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  26.58 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  29.15 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  25.4 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  29.34 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  27.73 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  27.39 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  29.22 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  26.51 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  30.08 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  26.16 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  26.16 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  26.16 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  26.94 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  26.58 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  29.06 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  29.06 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>