212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004140 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  100 
 
 		 251 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  88.84 
 
 		 263 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  54.58 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  52.59 
 
 		 251 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  51.61 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  50 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  50.61 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  49.6 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  50.81 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  48.73 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  47.28 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  47.28 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  36.73 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  43.21 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  36.95 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  36.95 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  38.1 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  30.12 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  30.12 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.19 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  26.53 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  28.63 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  27.8 
 
 		 266 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  27.91 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  27.91 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  27.91 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  28.03 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  27.54 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  25.62 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  26.03 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  25.4 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  25.51 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  26.4 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  27.87 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  25.32 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  26.21 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  25.62 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  25.62 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  25.62 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  26.03 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  30 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  24.59 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  27.54 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  25.4 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  28.65 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  25.4 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  28.76 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  28.44 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  28.25 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  26.67 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  26.07 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  25.21 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  24.79 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  27.92 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  28.95 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  25.3 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  24.28 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  23.58 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  23.58 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  23.58 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  30.77 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  23.58 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  23.58 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  26.87 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  26.92 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  26.45 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  26.25 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  28.71 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  25.31 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  26.02 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  28.22 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  27.98 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  26.64 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  28.23 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  29.03 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  32.23 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  26.2 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  28.8 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  30.13 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  21.76 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  29.21 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  29.2 
 
 		 265 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  29.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  29.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  29.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  25.81 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  29.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  29.03 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  31.68 
 
 		 121 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  29.03 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  29.5 
 
 		 260 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  28.18 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>