195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01324 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  88.84 
 
 		 251 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  53.2 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  52.99 
 
 		 251 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  50.4 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  48.76 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  52.85 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  49.6 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  50.61 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  47.48 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  45.61 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  45.61 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  36.73 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  45.27 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  36.22 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  36.61 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  38.19 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  29.23 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  29.23 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  29.23 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  27.85 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  26.16 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  27.95 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  27.95 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  27.92 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  28.77 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  26.48 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  32.68 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  26.46 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  25.88 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  27.71 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  26.61 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  25.4 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  27.16 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  24.9 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  26.79 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  25.32 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  25.21 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  26.75 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  27.47 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  26.75 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  26.09 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  24.59 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  25.79 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  27.5 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  26.51 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  26.51 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  27.11 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  25.4 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  24.69 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  24.8 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  26.94 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  31.61 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  34.26 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  28.9 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  32.67 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  25.7 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  31.82 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  23.32 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  23.32 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  31.61 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  31.61 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  31.61 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  31.61 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  31.61 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  30.23 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  30.57 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  23.32 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  23.95 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  27.52 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  23.32 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  27.71 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  28.31 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  26.75 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  26.75 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  29.76 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  24.78 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  29.22 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  30.32 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  33.51 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  28.39 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  29.63 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  27.11 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  26.03 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  26.19 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  30.72 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  33.66 
 
 		 121 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  25.9 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  27.4 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  27.98 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  30.32 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  25.21 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  25.32 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  26.59 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  26.19 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>