220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2997 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  478  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  73.9 
 
 
251 aa  332  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  68.42 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  67.35 
 
 
254 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  59.84 
 
 
258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  59.44 
 
 
253 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  61.07 
 
 
249 aa  255  5e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  54.58 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  60.17 
 
 
253 aa  247  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  53.2 
 
 
263 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  53.56 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  60.08 
 
 
258 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  53.14 
 
 
257 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  46.94 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  47.39 
 
 
270 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  44.62 
 
 
263 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  44.81 
 
 
270 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  31.01 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  31.13 
 
 
268 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  31.13 
 
 
268 aa  92.4  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  31.13 
 
 
268 aa  92.4  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  30.2 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  30.61 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  28.22 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  29.67 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  27.47 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  29.27 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  30.51 
 
 
253 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  28.28 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  29.87 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  27.87 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  32.89 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  27.57 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  30.86 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  28.05 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  28.05 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  27.69 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  28.81 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  29.96 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  29.26 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  29.26 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  28.95 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  30.93 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  27.98 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  31.36 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  29.88 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  26.86 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  32.5 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  27.76 
 
 
269 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  28.63 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  27.76 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  27.76 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  27.76 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  28.98 
 
 
259 aa  72  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  27.76 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  26.51 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  28.93 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  28.09 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  30.45 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  28.19 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  26.23 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  27.17 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  26.64 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  26.64 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  30.47 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  32.49 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  28.26 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  32.49 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  26.82 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  27.92 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  28.4 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  32.49 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  31.47 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  28.4 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  26.36 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  30.8 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  28.76 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  26.36 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  26.36 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  26.36 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  26.36 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  28.69 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  26.36 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  26.24 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>