224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0183 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
253 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  59.44 
 
 
251 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  59.84 
 
 
251 aa  268  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  55.92 
 
 
258 aa  255  4e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  59.11 
 
 
249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  57.79 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  55.87 
 
 
253 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  54.93 
 
 
254 aa  222  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  49.6 
 
 
263 aa  217  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  49.6 
 
 
251 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  53.53 
 
 
258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  46 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  43.37 
 
 
270 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  46.4 
 
 
257 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  43.78 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  44.54 
 
 
263 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  42.34 
 
 
270 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  28.94 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  24.7 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  28.25 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  28.57 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  29.33 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  28.28 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  27.8 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  29.15 
 
 
266 aa  72  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  30.33 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  30.33 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  30.33 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  23.01 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  28.22 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  28.92 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  29.25 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  29.88 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  26.72 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  26.51 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  27.24 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  27.23 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  27.23 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  27.39 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  28.4 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  28.4 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  28.22 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  28.15 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  29.18 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  27.12 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  28.9 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  32.51 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  26.07 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  26.78 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  29.1 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  27.63 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  28.51 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  28.7 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 
256 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  30.9 
 
 
260 aa  62  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  25.7 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  29.07 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  28.7 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  28.38 
 
 
252 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  28.7 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  27.2 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  26.11 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  27.2 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  33.33 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2179  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.403668  normal  0.519759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  23.77 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  25.4 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  26.58 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  23.77 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  28.76 
 
 
276 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  29.41 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  30.04 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  28.75 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  28.51 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  25.7 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  24.89 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  27.23 
 
 
255 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  29.75 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  26.8 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  27.66 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  29.66 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>