216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0953 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0953  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  494  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1054  hypothetical protein  70.68 
 
 
249 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  59.84 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0106  protein of unknown function DUF81  58.13 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.511143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1038  hypothetical protein  57.38 
 
 
249 aa  249  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.311606  normal  0.183068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1898  hypothetical protein  57.71 
 
 
254 aa  246  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  55.92 
 
 
253 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06631  permease  56.59 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.363494 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09121  hypothetical protein  48.64 
 
 
257 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  50.81 
 
 
253 aa  214  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0244  hypothetical protein  48.64 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  50 
 
 
251 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  48.76 
 
 
263 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  38.82 
 
 
270 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10571  permease  37.15 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10561  permease  41.15 
 
 
263 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.240384  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10571  permease  39.51 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  30.99 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  30.12 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  28.85 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  29.75 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  29.05 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  29.05 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  29.05 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  30.34 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  31.03 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  24.45 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  32.77 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  29.46 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  28.23 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  27.67 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  27.67 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  26.97 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  28.4 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  29.72 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  30.12 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  33.03 
 
 
286 aa  72  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  31.43 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  27.56 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  30.42 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  28.51 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  30.38 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  26.64 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  30.9 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  27.73 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  25.55 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  27.6 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  30.14 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  25.55 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  28.29 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  29.73 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  26.34 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  24.58 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  34.11 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  27.44 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  30 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  31.36 
 
 
251 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  26.14 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  27.49 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  28.94 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1224  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  27.03 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  26.97 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  26.96 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  25.73 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  27.13 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  25.73 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  25.73 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  25.73 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  24.19 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  26.72 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  24.19 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  27.36 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  24.18 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0966  hypothetical protein  32.93 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0162432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.05 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  25.32 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  28.34 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  23.17 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>