More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1616 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  42.99 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  36.13 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  34.85 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  36.55 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  36.67 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  36.71 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  33.61 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  30.86 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  34.22 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  33.76 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  31.67 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  29.71 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  28.51 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  29.57 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  31.8 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  32.1 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  31.4 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  29.17 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  26.16 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  28.33 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  32.5 
 
 		 281 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  30.74 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  32.66 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  32.66 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  32.66 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  32.66 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  32.66 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  32.77 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  30.21 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  29.22 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  31.94 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  30.68 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  29.58 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  26.69 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  32.1 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  28.94 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  30.17 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  29.83 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  26.69 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  29.83 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  29.83 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  30.17 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  29.36 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  31.12 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  29.88 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  26.69 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  26.53 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  31.93 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  26.69 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  31.69 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  31.93 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  30.77 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  26.53 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  31.65 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  29.36 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  26.53 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  32.89 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  26.05 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  30.61 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  26.05 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  26.05 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  26.05 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  28.27 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  30.64 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  28.88 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  28.63 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  28.75 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  29.55 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  28.34 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  31.76 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  28.75 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  29.49 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  28.63 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  30.29 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  31.84 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  28.96 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  29.76 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  28.11 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  27.69 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  28.1 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>