More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3908 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  76.59 
 
 		 253 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  62.3 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  44.84 
 
 		 252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  34.82 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  37.55 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  36.03 
 
 		 241 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  36.36 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  40.87 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  33.89 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  33.76 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  32.73 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  28.98 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  31.67 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  30.7 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  29.36 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  30.57 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  31.44 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  31.17 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  30.25 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  30.57 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  30.57 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  30.57 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  30.57 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  30.57 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  30.26 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  29.63 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  30.57 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  30.74 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  30.51 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  27.95 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  33.48 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  30.43 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  30.17 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  31.82 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  29.69 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  32.14 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  27.56 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  29.6 
 
 		 264 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  30.3 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  27.83 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  25.74 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  27.62 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  24.7 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  28.5 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  28.39 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1303  membrane protein  26.86 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  28.39 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  30.99 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  26.69 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  29.86 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  27.64 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  27.64 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  27.2 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  30.08 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  27.2 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  29.88 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  27.41 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  28.09 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  26.94 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  29 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  28.99 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  32.59 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25.74 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  27.23 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  26.86 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  26.47 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  27.15 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  27.85 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  27.49 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  27.82 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  26.72 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  27.39 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3087  hypothetical protein  26.64 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000225144 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  26.72 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  26.72 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  27.94 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  25.82 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1565  hypothetical protein  25.23 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.797209  hitchhiker  0.0000308798 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  28.21 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  26.58 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  28.38 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  25.53 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  24.78 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  27.23 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  25.79 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  27.23 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  25.64 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  28.88 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  29 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  28.88 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  25.64 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  26.79 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>