More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0145 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
249 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  58.23 
 
 
251 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  63.22 
 
 
256 aa  275  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  59.68 
 
 
254 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  61.09 
 
 
253 aa  251  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  60.73 
 
 
248 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  54.44 
 
 
262 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  51.2 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  50.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  51.19 
 
 
261 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  50.19 
 
 
260 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  50.6 
 
 
255 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  53.49 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  54.36 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  56.42 
 
 
259 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  50.39 
 
 
260 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  48.41 
 
 
261 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  50.78 
 
 
259 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  47.49 
 
 
260 aa  194  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  48.84 
 
 
276 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  47.49 
 
 
281 aa  191  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  52 
 
 
250 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
271 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  41.91 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  40.89 
 
 
247 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  40.49 
 
 
247 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  41.15 
 
 
253 aa  158  8e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  44.81 
 
 
275 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  38.73 
 
 
306 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
253 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  37.05 
 
 
276 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  37.27 
 
 
269 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  38.03 
 
 
251 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  40.55 
 
 
283 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  41.7 
 
 
239 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  41.27 
 
 
248 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  39.04 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  33.9 
 
 
251 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  36.6 
 
 
262 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  38.97 
 
 
251 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  39.51 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  34.43 
 
 
264 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  34.16 
 
 
251 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  36.84 
 
 
259 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  32.35 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  36.4 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  32.34 
 
 
256 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  36.24 
 
 
246 aa  129  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  39.66 
 
 
247 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  35.04 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  31.69 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  31.69 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  31.69 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  32.1 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  38 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  37.92 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  41.22 
 
 
255 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  31.69 
 
 
252 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  33.77 
 
 
251 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  33.61 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  34.5 
 
 
251 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  39.53 
 
 
253 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  31.02 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  35.74 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  39.18 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  36.32 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  35.65 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  35.65 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  37.6 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  35.27 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  36.14 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  41.25 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  32.19 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  38.91 
 
 
257 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  30.98 
 
 
292 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  30.04 
 
 
265 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  33.61 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  36.29 
 
 
247 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  37.55 
 
 
247 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  34.42 
 
 
261 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 
258 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  38.24 
 
 
277 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  36.04 
 
 
249 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  38.24 
 
 
269 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  32.49 
 
 
253 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  38.24 
 
 
277 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  34.58 
 
 
249 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  31.28 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  36.48 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  34.42 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  36.4 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  28.44 
 
 
247 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 
252 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  28.98 
 
 
253 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  35.66 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  34.58 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  38.05 
 
 
245 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  35.86 
 
 
246 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>