More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3094 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  76.59 
 
 		 252 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  63.64 
 
 		 253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  45.04 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  39.83 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  37.7 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  37.04 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  42.61 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  36.24 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  36.89 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0440  hypothetical protein  36.78 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  34.1 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  34.22 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  34.22 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  28.91 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  30.38 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  29.31 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  28.63 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  29.62 
 
 		 257 aa  95.1  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  29.74 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  29.31 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  29.31 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  29.31 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  29.31 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  29.31 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  28.45 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  27 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  29.39 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  28.99 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  33.48 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  28.95 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  28.88 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  29.74 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  28.87 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  28.87 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  29.11 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  29.69 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  29.15 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  29.72 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  32.66 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  30.3 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  32.63 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  27.39 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  27.16 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  26.29 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  28.51 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  28.51 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  30.13 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  28.95 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  28.51 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  30.99 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  28.88 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  28.94 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  26.18 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  28.87 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  23.58 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  27.31 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  27.82 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  31.11 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  26.58 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  29.3 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  27.71 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  28.02 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  30.64 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  29.34 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  32.47 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  28.02 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  26.67 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  28.92 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  28.12 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  26.32 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  28.92 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  27.59 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  28.11 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  27.5 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  29.8 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  29.63 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  29.34 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  29.84 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  27.59 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  28.92 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  27.16 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  28.51 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  28.52 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  28.39 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  27.27 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  28.52 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  28.52 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>