More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02417 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  500  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  91.41 
 
 		 256 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  61.18 
 
 		 261 aa  291  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  60.78 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  39.2 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  36.11 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  39.84 
 
 		 252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  36.4 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  39.43 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  38.1 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  38.1 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  38.1 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  38.89 
 
 		 252 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  39.84 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  39.84 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  35.98 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  37.25 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  39.84 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  41.04 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  38.68 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  34.15 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  35.48 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  34.15 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  35.02 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  37.86 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  38.02 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  37.34 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  37.98 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  32.77 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  34.27 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  34.29 
 
 		 239 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  33.87 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  40.32 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  31.73 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  31.08 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  32.76 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  33.61 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  32.92 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  34 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  32.02 
 
 		 262 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  31.91 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  38.25 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  40.68 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  31.92 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  32.47 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  38.91 
 
 		 249 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  32.4 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  31.97 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  29.92 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  28.46 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  31.35 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  34.36 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  32.27 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  31.84 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  37.19 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  31.62 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  31.6 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  30.34 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  27.78 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  35.39 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  33.6 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  29.73 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  35.98 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  34.35 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  30.58 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  38.74 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  36.18 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  32.08 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  30.86 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  30.12 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  31.13 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  34.19 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  29.63 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  27.24 
 
 		 292 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  41.32 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.77 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  38.91 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  38.08 
 
 		 257 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  34.57 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  29.34 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  30.4 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  30.54 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  28.45 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3595  permease-like protein  36.53 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487773  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  27.13 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  31.64 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  28.29 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  28.85 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  29.36 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  26.61 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  35.71 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>