More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0511 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  69.83 
 
 
256 aa  328  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  72.29 
 
 
248 aa  321  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  58.04 
 
 
254 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  52.19 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  58.92 
 
 
249 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  55.65 
 
 
253 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  49.61 
 
 
262 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  48.58 
 
 
255 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  47.64 
 
 
260 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  47.64 
 
 
260 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  52.33 
 
 
260 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  55.65 
 
 
259 aa  208  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  46.83 
 
 
261 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  52.05 
 
 
258 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  53.01 
 
 
250 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  50.97 
 
 
259 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  43.6 
 
 
271 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  44.87 
 
 
281 aa  192  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  45.7 
 
 
261 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  48.64 
 
 
276 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  48.06 
 
 
260 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  46.9 
 
 
260 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  43.04 
 
 
253 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  39.55 
 
 
269 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  44.53 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  43.46 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  39.93 
 
 
306 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  46.69 
 
 
251 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  38 
 
 
247 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 
247 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  36.8 
 
 
248 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.5 
 
 
239 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 
251 aa  151  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  39.39 
 
 
252 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  36.18 
 
 
251 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  37.79 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  34.02 
 
 
276 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  35.84 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  34.31 
 
 
248 aa  138  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  40.42 
 
 
256 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  40.98 
 
 
255 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  34.17 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  38.33 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  33.88 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  41.56 
 
 
256 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  32.24 
 
 
264 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  30.28 
 
 
253 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  32.92 
 
 
256 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  39.91 
 
 
247 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  40.28 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  32.18 
 
 
292 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  38.17 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  38.02 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  38.02 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  35.94 
 
 
259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  38.84 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  34.04 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  31.17 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  36.61 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  34.57 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  30.43 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  43.41 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  35.39 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  39.2 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  34.29 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  37.39 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 
252 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  34.57 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 
247 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  41.91 
 
 
277 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  34.36 
 
 
251 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  41.91 
 
 
269 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  32.13 
 
 
254 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  41.91 
 
 
277 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  34.41 
 
 
252 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  34.01 
 
 
252 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  35.63 
 
 
253 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  33.74 
 
 
252 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  33.91 
 
 
251 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  29.08 
 
 
261 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  31.36 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  38.33 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  29.03 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  32.77 
 
 
252 aa  96.3  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  39.91 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  36.28 
 
 
246 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  30.92 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  36.28 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1945  hypothetical protein  28.51 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.474883  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1616  protein of unknown function DUF81  28.51 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.821301  hitchhiker  0.00129532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  27.84 
 
 
252 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  29.15 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  40.17 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3595  permease-like protein  37.65 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487773  normal  0.963136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>