250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3996 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  63.31 
 
 
249 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  58.3 
 
 
252 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  58.3 
 
 
252 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  61.04 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  54.31 
 
 
233 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  41.87 
 
 
264 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  43.72 
 
 
254 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  44.58 
 
 
258 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  44.58 
 
 
258 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  44.07 
 
 
253 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  39.53 
 
 
259 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  37.94 
 
 
276 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  36.8 
 
 
251 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  38.03 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  37.71 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  42.02 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  36.25 
 
 
251 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  38.86 
 
 
248 aa  141  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  35.86 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  36.86 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  33.2 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  35.06 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  35.06 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  40.77 
 
 
248 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  35.06 
 
 
252 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  42.23 
 
 
252 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  40 
 
 
260 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  40 
 
 
260 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  41.2 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  41.78 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  39.75 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  41.56 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  41.33 
 
 
247 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  41.94 
 
 
239 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  37.71 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  38.7 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  37.05 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  43.5 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  43.5 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  43.9 
 
 
245 aa  125  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 
250 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  33.2 
 
 
256 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  37.72 
 
 
256 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  36.8 
 
 
249 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  43.9 
 
 
245 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  34.18 
 
 
252 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  43.9 
 
 
245 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  33.6 
 
 
265 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  40.74 
 
 
247 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  40.34 
 
 
249 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  37.73 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  41.06 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  32.27 
 
 
251 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  34.4 
 
 
261 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  41.87 
 
 
245 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  41.46 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  38.27 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  40.49 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  39.83 
 
 
249 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  41.3 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  29.34 
 
 
262 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  32.81 
 
 
261 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
246 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  43.15 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  39.33 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  33.6 
 
 
251 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  42.04 
 
 
245 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  38.46 
 
 
249 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  34.18 
 
 
262 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  36.25 
 
 
260 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
261 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  37.35 
 
 
251 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  33.21 
 
 
283 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
260 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 
253 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  36.67 
 
 
255 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
247 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  41.6 
 
 
247 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  35.11 
 
 
253 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  36.56 
 
 
255 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  29.34 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  36.11 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  32.79 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  38.28 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  27.07 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  36.45 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  30.08 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  40.43 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  32.93 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  36.82 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  35.43 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  47.46 
 
 
306 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 
276 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  39.68 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>