231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3379 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
253 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  63.56 
 
 
247 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  61.66 
 
 
255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  58.04 
 
 
255 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  63.2 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  63.2 
 
 
269 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  63.2 
 
 
277 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  41.2 
 
 
253 aa  183  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  39.53 
 
 
262 aa  174  8e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  48.72 
 
 
247 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  44.26 
 
 
258 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
249 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  41.92 
 
 
252 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  37.45 
 
 
261 aa  137  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  44.26 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  40.89 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  38.52 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  38.89 
 
 
254 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  37.86 
 
 
256 aa  125  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  35.15 
 
 
251 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 
252 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  37.85 
 
 
271 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  38.65 
 
 
253 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  30.74 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  34.68 
 
 
251 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  37.5 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  38.52 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  38.7 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  37.83 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  34.65 
 
 
262 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  30.62 
 
 
256 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  36.06 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  37.3 
 
 
248 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  34.66 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  34.66 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 
260 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.04 
 
 
239 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  33.05 
 
 
261 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  35.46 
 
 
251 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  34.43 
 
 
255 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
259 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  32.26 
 
 
251 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  34.73 
 
 
283 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  32.81 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  32.56 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  33.07 
 
 
269 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  35.48 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  33.77 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  34.02 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  30.86 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  31.08 
 
 
252 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  92  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  33.33 
 
 
281 aa  91.7  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  30.68 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  37.23 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  30.71 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  35.98 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  32.4 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  29.76 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  32.53 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  31.41 
 
 
306 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  37.14 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 
252 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  30.42 
 
 
252 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  31.67 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  33.2 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  31.25 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  36.79 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  34.76 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.8 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  26.98 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  34.03 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  27.65 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  29.96 
 
 
251 aa  82  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  36.27 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  33.74 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  33.74 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  33.75 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  33.21 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  27.45 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  28.15 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  33.91 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  37.22 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  26.43 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  32.54 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  26.41 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  37.02 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  35.78 
 
 
245 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  30.47 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  29.24 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  33.73 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>