279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2125 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  84.29 
 
 
261 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  57.48 
 
 
260 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  52.11 
 
 
260 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  52.11 
 
 
260 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  52.94 
 
 
255 aa  255  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  54.75 
 
 
281 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  52.49 
 
 
260 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  52.11 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  52.11 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  54.24 
 
 
259 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  51.21 
 
 
249 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  46.83 
 
 
251 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  48.61 
 
 
262 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  46.61 
 
 
252 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  49.17 
 
 
253 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  48.83 
 
 
254 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  46.43 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  44.8 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  45.74 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  40.96 
 
 
269 aa  162  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 
271 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  40.24 
 
 
253 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  40.56 
 
 
253 aa  151  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  42.47 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  46.35 
 
 
250 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  32.65 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  34.84 
 
 
251 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  36.98 
 
 
283 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  37.77 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.97 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  37.65 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  33.79 
 
 
306 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  32.39 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  33.98 
 
 
276 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  32.22 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  35.92 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  31.2 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  36.8 
 
 
260 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  29.44 
 
 
253 aa  112  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  36.7 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  33.74 
 
 
252 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  33.74 
 
 
252 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  31.06 
 
 
256 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
253 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  35.87 
 
 
257 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  31.1 
 
 
252 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  31.84 
 
 
261 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  31.66 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  30.43 
 
 
252 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  29.92 
 
 
252 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  29.92 
 
 
252 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  29.76 
 
 
251 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  29.88 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  34.57 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  27.52 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  37.34 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  34.4 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  35.16 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  31.75 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  31.9 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  31.1 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  34.78 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  34.4 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  30.28 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  29.17 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  29.51 
 
 
261 aa  92  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  30.04 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  30.65 
 
 
265 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  32.11 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  26.51 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  32.91 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  27.62 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  25.21 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  33.77 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  27.2 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  27.71 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  28.75 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  34.03 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  32.58 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  25.3 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  34.22 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  32.81 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  35.89 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  28.14 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  23.11 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3595  permease-like protein  32.95 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487773  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  25.73 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  34.01 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>