278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1521 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  478  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  64.66 
 
 
255 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  42.34 
 
 
251 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  47.39 
 
 
271 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  59.03 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  38.75 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  43.48 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  43.21 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  43.27 
 
 
253 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  42.19 
 
 
256 aa  158  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  41.63 
 
 
252 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  37.15 
 
 
260 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  37.15 
 
 
260 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  37.5 
 
 
255 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  39.66 
 
 
251 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  38.37 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  42.74 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  38.78 
 
 
249 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  39.29 
 
 
260 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  39.6 
 
 
248 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  35.57 
 
 
261 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  39.02 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  39.59 
 
 
247 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  35.43 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  34.41 
 
 
251 aa  145  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  37.35 
 
 
260 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  40.36 
 
 
251 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  39 
 
 
239 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  39.18 
 
 
247 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  35.02 
 
 
276 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  35.98 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  37.19 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  40.73 
 
 
248 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  39.41 
 
 
253 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  35.71 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  42.26 
 
 
259 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  40.57 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  34.5 
 
 
281 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  32.23 
 
 
261 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  37.15 
 
 
306 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  35.2 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  38.58 
 
 
259 aa  123  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  35.16 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  33.98 
 
 
252 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 
251 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  34.38 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  34.77 
 
 
252 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  34.77 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  35.04 
 
 
254 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  32.2 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  32.2 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  29.41 
 
 
253 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  32.77 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  38.22 
 
 
252 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  38.19 
 
 
258 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  38.19 
 
 
258 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 
255 aa  112  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  33.61 
 
 
265 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  35.8 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  36.61 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  33.08 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  37.04 
 
 
253 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  28.75 
 
 
262 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  37.23 
 
 
250 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  33.2 
 
 
269 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  32.64 
 
 
251 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  36.58 
 
 
246 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  36.13 
 
 
252 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  29.73 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  38.93 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  36.23 
 
 
275 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  39.74 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  39.74 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  38.36 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  28.39 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  38.72 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 
247 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3595  permease-like protein  37.58 
 
 
233 aa  87  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487773  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  36.36 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  33.48 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  35.1 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  32.74 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  30.51 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.4 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  29.58 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  30.54 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  32.82 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  24.89 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  35.02 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  39.13 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>