240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3457 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
251 aa  464  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  51.01 
 
 
253 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  50.79 
 
 
253 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  46.69 
 
 
251 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  46.75 
 
 
252 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  42.57 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  44.49 
 
 
256 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
251 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  45.7 
 
 
258 aa  158  9e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  41.88 
 
 
239 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  41.45 
 
 
247 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  47.88 
 
 
248 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  41.03 
 
 
247 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  40.59 
 
 
248 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  38.43 
 
 
276 aa  150  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  44.49 
 
 
254 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  35.42 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  38.27 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 
249 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  42.86 
 
 
262 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  34.94 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  38.91 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  38 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  33.2 
 
 
256 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  32.94 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  42.39 
 
 
281 aa  128  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  38.4 
 
 
251 aa  126  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  40.91 
 
 
283 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  37.05 
 
 
251 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  30.92 
 
 
246 aa  122  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  38.4 
 
 
251 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  41.6 
 
 
259 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  36.76 
 
 
252 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  36.51 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  35.42 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  36.03 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  36.76 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  36.55 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 
252 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  36.82 
 
 
269 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  38.63 
 
 
255 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
260 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  35.2 
 
 
253 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  33.61 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  31.69 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  32.92 
 
 
253 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  35.98 
 
 
248 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  41.08 
 
 
255 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  41.92 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  30.58 
 
 
261 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  34.89 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  36.18 
 
 
276 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  38.8 
 
 
255 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 
259 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  38.1 
 
 
250 aa  105  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  37.55 
 
 
261 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  37.4 
 
 
252 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  38.75 
 
 
247 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
247 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  38.3 
 
 
249 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 
255 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  35.27 
 
 
254 aa  99  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  36.69 
 
 
258 aa  99  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  36.69 
 
 
258 aa  99  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  30.28 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  40.5 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  38.22 
 
 
275 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  36.84 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  38.14 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  36.44 
 
 
260 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  27.83 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  40.25 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  36.95 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  39.63 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  42.54 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  33.07 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  35.78 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  34.92 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  29.28 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  38.27 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  38.27 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  38.27 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  30.3 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  25.78 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  30.43 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  32.63 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  38.02 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  28.97 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  28.97 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  32.93 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  27.9 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.11 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  42.33 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>