280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4164 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  99.6 
 
 
249 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  61.04 
 
 
249 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  48.19 
 
 
252 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  49.8 
 
 
251 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  47.18 
 
 
252 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  47.18 
 
 
252 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  46.99 
 
 
252 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  47.18 
 
 
252 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  50.85 
 
 
251 aa  201  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  51.27 
 
 
251 aa  201  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  51.27 
 
 
251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  53.2 
 
 
252 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  50.4 
 
 
254 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  53.47 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  53.47 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  51.65 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  40.32 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  48.57 
 
 
252 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  40.65 
 
 
264 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  43.54 
 
 
252 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  43.54 
 
 
252 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  41.87 
 
 
247 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  41.99 
 
 
256 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  42.44 
 
 
260 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  38.34 
 
 
261 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  42.74 
 
 
248 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  42.68 
 
 
259 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  39.68 
 
 
265 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  39.18 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  38.01 
 
 
251 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  42.02 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  38.34 
 
 
271 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  42.11 
 
 
247 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  41.3 
 
 
247 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  46.28 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  40.34 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  42.44 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  38.8 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  38.8 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  39.27 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  41.42 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  39.57 
 
 
248 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  38.72 
 
 
233 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  41.08 
 
 
253 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  37.61 
 
 
252 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  41.53 
 
 
249 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  38.64 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  45.02 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 
251 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  41.39 
 
 
258 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  39.59 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  39.18 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  39.18 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  39.27 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  39.68 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  38.11 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  51.84 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  37.17 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  38.87 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  36.61 
 
 
262 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 
252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  38.87 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  38.87 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  53.33 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  38.02 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  40.42 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  39.32 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  38.93 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  38 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  33.19 
 
 
251 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  43.31 
 
 
259 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  34.03 
 
 
261 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  39.84 
 
 
245 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  51.88 
 
 
257 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  35.85 
 
 
283 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  39.52 
 
 
246 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  36 
 
 
260 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  34.24 
 
 
281 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  35.79 
 
 
306 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  33.47 
 
 
269 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  46.72 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  30.63 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  40.32 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  38.14 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  38.15 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  35.47 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  40.09 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  37.6 
 
 
247 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  46.7 
 
 
246 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  34.41 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  46.26 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  35.46 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>