276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3876 on replicon NC_009007
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  99.6 
 
 		 249 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  61.04 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  48.59 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  50.2 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  47.58 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  47.58 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  47.39 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  47.58 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  51.27 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  50.85 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  51.27 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  53.2 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  50.81 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  53.47 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  53.47 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  52.32 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  40.32 
 
 		 256 aa  171  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  48.57 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  40.65 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  43.54 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  43.54 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  41.46 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  42.44 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  41.56 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  38.34 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  42.46 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  42.34 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  39.68 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  39.26 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  38.01 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  42.02 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  42.11 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  46.69 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  42.68 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  39.2 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  39.2 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  39.68 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  40.34 
 
 		 252 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  42.44 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  41.42 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  39.57 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  38.72 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  41.08 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  37.61 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  41.53 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  38.22 
 
 		 249 aa  121  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  39.59 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  39.59 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  45.02 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  42.26 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  41.39 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  39.68 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  38.21 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  39.27 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  37.01 
 
 		 262 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  37.28 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  51.84 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  32.93 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  38.87 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  38.87 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  38.87 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  38.02 
 
 		 253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  40.42 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  53.33 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  38.4 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  39.32 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  33.19 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  40.24 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  34.03 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  43.31 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  35.85 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  51.88 
 
 		 257 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  36 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  39.11 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  34.77 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  35.79 
 
 		 306 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  46.72 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  33.06 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  30.63 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  40.32 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  38.43 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  35.47 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  40.09 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  38 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  37.75 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  46.7 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  34.41 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  46.26 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  35.77 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>