256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13570 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  100 
 
 
275 aa  518  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  44.53 
 
 
251 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  45.28 
 
 
256 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  43.82 
 
 
260 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  43.82 
 
 
260 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  42.7 
 
 
252 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  47.39 
 
 
259 aa  184  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  44.92 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  41.31 
 
 
261 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  47.99 
 
 
254 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  45.66 
 
 
249 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  43.84 
 
 
281 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  48.45 
 
 
259 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  45 
 
 
258 aa  175  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  42.7 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  43.33 
 
 
260 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  44.57 
 
 
260 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  42.75 
 
 
253 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  45.32 
 
 
260 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  45.25 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  45.26 
 
 
248 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  38.95 
 
 
269 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  38.34 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  40.67 
 
 
276 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  41.4 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  38.69 
 
 
247 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  37.73 
 
 
247 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  36.76 
 
 
276 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.79 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  38.66 
 
 
248 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  36.98 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  34.2 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  37.02 
 
 
253 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  38.32 
 
 
250 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  34.47 
 
 
306 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  34.47 
 
 
253 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  32.21 
 
 
264 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  33.09 
 
 
256 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  28.85 
 
 
262 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  39 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  29.37 
 
 
251 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  40.54 
 
 
256 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  36.61 
 
 
256 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  29.8 
 
 
251 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  32.82 
 
 
248 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  30.97 
 
 
252 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  37.05 
 
 
251 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  31.72 
 
 
252 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  32.16 
 
 
292 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  29.28 
 
 
252 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  30.22 
 
 
252 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  30.22 
 
 
252 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  35.16 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  32.97 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  34.75 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  32.97 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  36.44 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  30.24 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  30.24 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  31.95 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  30.56 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  33.46 
 
 
252 aa  93.6  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  34.1 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  26.49 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  27.17 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  33.58 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  32.52 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  32.23 
 
 
252 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  30.08 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  30.8 
 
 
247 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  27.76 
 
 
251 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  28.52 
 
 
251 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  25.65 
 
 
261 aa  86.3  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  32.21 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  30.63 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  27.73 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  32.14 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  33.19 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  29.33 
 
 
254 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  34.2 
 
 
247 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  35.19 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  35.19 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  34.81 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  34.33 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  32.83 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  33.46 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  34.51 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  33.7 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  33.7 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  34.02 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.57 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  26.95 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  33.85 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  33.85 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  32.43 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  33.85 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  36.23 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>