More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1219 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  80.08 
 
 
258 aa  316  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  80.08 
 
 
258 aa  316  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  57.79 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  57.79 
 
 
252 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  57.38 
 
 
252 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  57.79 
 
 
252 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  56.97 
 
 
252 aa  254  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  55.08 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  53.91 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  54.66 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  54.24 
 
 
251 aa  231  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  55.24 
 
 
254 aa  221  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  67.49 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  39.2 
 
 
264 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  67.08 
 
 
257 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  52.59 
 
 
249 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  38.89 
 
 
256 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  37.85 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  55.36 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  65.83 
 
 
257 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  42.26 
 
 
252 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  42.26 
 
 
252 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  44.8 
 
 
252 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  35.43 
 
 
261 aa  164  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  53.22 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  38.1 
 
 
265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  40.76 
 
 
260 aa  159  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  37.05 
 
 
251 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  37.86 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  39.29 
 
 
253 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  48.96 
 
 
247 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  39.29 
 
 
258 aa  151  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  40.87 
 
 
248 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  39.27 
 
 
239 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  39.52 
 
 
247 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  39.11 
 
 
247 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  40.8 
 
 
248 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  42.23 
 
 
252 aa  148  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  38 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  44.44 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  36.51 
 
 
252 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  36.61 
 
 
247 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  45.27 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  49.2 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  38.3 
 
 
256 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  36.05 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  33.74 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  39.92 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  35.74 
 
 
260 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  35.74 
 
 
260 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  35.87 
 
 
251 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  44.35 
 
 
246 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  36.13 
 
 
255 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  34.25 
 
 
246 aa  123  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  45.26 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  45.49 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  39.44 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  45.26 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  31.02 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  36.17 
 
 
233 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  36.76 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  34.41 
 
 
254 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  33.46 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  35.16 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  29.27 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  40.76 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  40.76 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  36.14 
 
 
260 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  35.74 
 
 
260 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  34.76 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  42.26 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  41.42 
 
 
247 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  32.95 
 
 
262 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  39 
 
 
245 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  39.43 
 
 
245 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  38.17 
 
 
245 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 
260 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  38.17 
 
 
245 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  39.43 
 
 
245 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  39.43 
 
 
245 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  34.69 
 
 
259 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  37.04 
 
 
258 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  37.34 
 
 
246 aa  98.6  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  31.89 
 
 
276 aa  98.6  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  39.92 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  32.91 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.58 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  27.38 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  37.35 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  32.28 
 
 
283 aa  95.5  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  28.15 
 
 
253 aa  95.5  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  38.07 
 
 
253 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  30.47 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  31.58 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>