More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1858 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1858  permease  100 
 
 		 253 aa  502  1e-141  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  43.95 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  41.2 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  37.12 
 
 		 261 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  37.8 
 
 		 247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  36.63 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  34.33 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  30.28 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  29.08 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  29.08 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  34.71 
 
 		 258 aa  121  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  32.62 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  35.08 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  31.03 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  35.08 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  30.6 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  35.08 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  35.66 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  29.66 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  32.92 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  30.21 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  30.74 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  31.15 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  32.19 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  29.25 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  33.04 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  29.03 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  27.94 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  30.83 
 
 		 292 aa  105  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  27.38 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  28.09 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  30.8 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  31.2 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  26.21 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  30.24 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  26.4 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.14 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  29.77 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  29.49 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  25.51 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  29.36 
 
 		 247 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  28.28 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  28.94 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  32.91 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  28.94 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  26.5 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  23.75 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  23.75 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  25.61 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  26.78 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  29.1 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  31.62 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  29.41 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 276 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  30.49 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  28.09 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  28.09 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  26.79 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  26.36 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  24.6 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  28.46 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  25.39 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  27.07 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  27.43 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  27.8 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  25.82 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  28.88 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  28.63 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  27.8 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  29.83 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  23.62 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  27.8 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  27.39 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  28.38 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  24.69 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  28.15 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  27.93 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  27.73 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  28.19 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  24.9 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  24.38 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  24.38 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  23.11 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  24.38 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  25.11 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  26.83 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  26.83 
 
 		 257 aa  72  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>