174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1957 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  100 
 
 		 245 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  45.49 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  39.2 
 
 		 262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  48.78 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  35.66 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  44.76 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  38.11 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  40.44 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  43.15 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  41.67 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  36.1 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  37.65 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  44.98 
 
 		 277 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  44.98 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  44.98 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  34.75 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  40.35 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  37.28 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  43.67 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  38.98 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  37.34 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  36.12 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  36.12 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  36.12 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  38.05 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  39.06 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  35.09 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  32.64 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  34.7 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  37.66 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  31.15 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  34.74 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  37.24 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  37.56 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  37.56 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  38.94 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.1 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  36.13 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  31.56 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  32.93 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  34.36 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  36.78 
 
 		 283 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  38.84 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  32.31 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  38.22 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  33.06 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  37 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  33.65 
 
 		 276 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  33.58 
 
 		 306 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  30.33 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  30.34 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  34.36 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  32.77 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  36.78 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  35.27 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  35.27 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  31.11 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  27.46 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  39.3 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  27.87 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  32.89 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  31.91 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  31.56 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  28.76 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  28.76 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  39.15 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  33.06 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  32.64 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  30.4 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  33.19 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  31.2 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  32.93 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  30.97 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  31.58 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  28.81 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  31.42 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  31.42 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  30.53 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  30.09 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  30.67 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  35.25 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  37.22 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  34.18 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  29 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  20.99 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  30.93 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  33.03 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0626  protein of unknown function DUF81  33.9 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  34.91 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  37.62 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1011  hypothetical protein  33.04 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0235479 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  34.48 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  29.72 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>