More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2227 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  57.31 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  49.2 
 
 
251 aa  227  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  59.91 
 
 
253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  49.37 
 
 
271 aa  202  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  39.09 
 
 
252 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  41.7 
 
 
251 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  41.09 
 
 
260 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  41.09 
 
 
260 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  41.25 
 
 
255 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  37.45 
 
 
251 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  35.69 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  40.17 
 
 
253 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  39.66 
 
 
253 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  42.55 
 
 
239 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  38.82 
 
 
252 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  42.13 
 
 
247 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  42.55 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  41.35 
 
 
256 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  37.94 
 
 
262 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  35.6 
 
 
261 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  39.53 
 
 
254 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  40.83 
 
 
258 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  41.22 
 
 
248 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  36.44 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  39.92 
 
 
283 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  38.91 
 
 
260 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  36.65 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  38.2 
 
 
248 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  33.86 
 
 
256 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  34.45 
 
 
264 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  31.89 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  42.52 
 
 
251 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  33.76 
 
 
261 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  38.52 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  36.96 
 
 
260 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  40.85 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  34.41 
 
 
269 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  36.26 
 
 
306 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  42.17 
 
 
259 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  36.55 
 
 
260 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  36.08 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  36 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  30.08 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  34.54 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  39.04 
 
 
258 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  39.04 
 
 
258 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  37.93 
 
 
252 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  36.14 
 
 
252 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  35.89 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  37.35 
 
 
252 aa  111  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  33.99 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  37.85 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  35.98 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  35.48 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  35.48 
 
 
252 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  37.66 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  37.02 
 
 
254 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  35.17 
 
 
248 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  36.93 
 
 
251 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  34.3 
 
 
253 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  31.09 
 
 
265 aa  105  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 
255 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 
253 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  38.31 
 
 
247 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  30.36 
 
 
292 aa  99.4  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  36.56 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  35.57 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  42.86 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  29.82 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  40.25 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  42.74 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  36.6 
 
 
246 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  34.45 
 
 
249 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  38.91 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  36.92 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  35.74 
 
 
246 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  34.92 
 
 
246 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  33.94 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  31.67 
 
 
256 aa  89  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  34.85 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  29.96 
 
 
261 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  32.92 
 
 
269 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  32.08 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  32.92 
 
 
269 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  32.11 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  32.52 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  32.3 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  38.33 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>