216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3008 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  68.3 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  42.91 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  37.86 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  40.67 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  41.24 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  41.24 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  42.96 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  41.83 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  42.22 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  34.4 
 
 		 251 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  36.86 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  35.56 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  38.91 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  39.71 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  39.34 
 
 		 247 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  42.64 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  39.3 
 
 		 239 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  38.4 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  38.13 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  36.4 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  39.15 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  38.21 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  37.41 
 
 		 248 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  33.82 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  38.32 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  38.69 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  36.88 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  40.78 
 
 		 251 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  30.63 
 
 		 276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  36.72 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  37.23 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  34.3 
 
 		 251 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  33.33 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  31.91 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  41.4 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  38.93 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 		 276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  38.26 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  33.08 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  34.04 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  31.87 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  30.65 
 
 		 256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  33.59 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  34.38 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  39.06 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  33.45 
 
 		 247 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  36.63 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  27.64 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  32.21 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  31.7 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  31.7 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  34.41 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  30.11 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  33.57 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  31.1 
 
 		 254 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  29.75 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  30.11 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  29.75 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  34.43 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  34.43 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  35.25 
 
 		 258 aa  99  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  29.06 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  28.68 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  28.67 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  29.04 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  33.96 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  33.46 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  29.39 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  26.14 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  36.53 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  28.03 
 
 		 265 aa  92.4  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  27.92 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  34.65 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  33.09 
 
 		 252 aa  89.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  36.9 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  28.41 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  25.39 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  35.23 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  33.21 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  39.02 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  30.58 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  33.71 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  35.36 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  33.58 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  32.85 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  34.6 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  29.74 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  28.19 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  34.5 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  35.27 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  38.05 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  31.27 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  31.27 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1600  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>