226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1662 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  96.02 
 
 
251 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  96.81 
 
 
251 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  94.82 
 
 
251 aa  434  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  77.38 
 
 
252 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  77.78 
 
 
252 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  77.25 
 
 
252 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  77.25 
 
 
252 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  76.08 
 
 
252 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  53.2 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  50.4 
 
 
254 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  48.24 
 
 
248 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  50.62 
 
 
258 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  50.62 
 
 
258 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  51.01 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  51.06 
 
 
249 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  47.48 
 
 
249 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  36.93 
 
 
252 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  36.93 
 
 
252 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  37.74 
 
 
256 aa  151  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  39.51 
 
 
261 aa  149  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.55 
 
 
239 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  38.27 
 
 
252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  37.15 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  38.49 
 
 
260 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  34.82 
 
 
276 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  40.48 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  36.36 
 
 
251 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  33.61 
 
 
264 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  35.32 
 
 
248 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  43.5 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  38.4 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  37.8 
 
 
259 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  34.54 
 
 
247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  43.62 
 
 
247 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  37.8 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  40.74 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  36.25 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  35.95 
 
 
253 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  35.89 
 
 
271 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  52.05 
 
 
260 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  38.55 
 
 
245 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  38.96 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  34 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  38.34 
 
 
251 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  33.75 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  38.71 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  38.71 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  37.05 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  39.42 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  51.67 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  32.07 
 
 
252 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  33.6 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  31.13 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  34.71 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  35.17 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  35.12 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  51.25 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  34.63 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  37.65 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  40.82 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  32.18 
 
 
281 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  37.25 
 
 
245 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  37.25 
 
 
245 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 
258 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  31.74 
 
 
251 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  36.44 
 
 
245 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  30.71 
 
 
251 aa  105  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  35.48 
 
 
260 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  30.95 
 
 
246 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  40.69 
 
 
253 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  29.37 
 
 
261 aa  99  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  35.37 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  34.54 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  37.69 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
259 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  39.26 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  32.66 
 
 
260 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  31.89 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  32.39 
 
 
248 aa  94  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  31.85 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  30.56 
 
 
252 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  36.44 
 
 
245 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  37.1 
 
 
247 aa  91.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  30.68 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  37.5 
 
 
247 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  27.49 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  33.61 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  30.36 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  30.61 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2785  protein of unknown function DUF81  40.66 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  28.89 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  37.83 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  37.83 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>