294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4591 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
259 aa  494  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  71.71 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  71.71 
 
 
260 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  72.73 
 
 
255 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  71.32 
 
 
260 aa  328  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  70.93 
 
 
260 aa  311  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  66.41 
 
 
260 aa  311  7.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  54.07 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  57.85 
 
 
259 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  53.66 
 
 
261 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  50.97 
 
 
251 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  52.61 
 
 
256 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  53.99 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  50.99 
 
 
262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  47.43 
 
 
252 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  51.2 
 
 
249 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  51.76 
 
 
254 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  50.61 
 
 
253 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  50.19 
 
 
248 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  46.01 
 
 
275 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  47.18 
 
 
258 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  42.19 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  46.3 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  40.52 
 
 
269 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  45.91 
 
 
250 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  40.16 
 
 
253 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  40.5 
 
 
239 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  37.05 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  39.76 
 
 
253 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 
247 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  36.4 
 
 
276 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  40.82 
 
 
248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  34.44 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  33.06 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  33.06 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  37.84 
 
 
251 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  33.89 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  36.72 
 
 
283 aa  123  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  31.23 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  35.17 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  34.04 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  34.27 
 
 
252 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  31.84 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  33.87 
 
 
252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  33.06 
 
 
252 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  32.66 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  33.47 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  36.65 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  32.77 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  37.24 
 
 
252 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  36.82 
 
 
253 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
253 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  30.08 
 
 
262 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  32.39 
 
 
251 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  38.1 
 
 
247 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  38.02 
 
 
255 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 
251 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  33.76 
 
 
251 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  32.49 
 
 
251 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  34.13 
 
 
259 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  34.9 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  31.49 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  31.49 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  40.24 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  38.2 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  37.19 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  38.84 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  34.11 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  36.25 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  36.07 
 
 
247 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.48 
 
 
247 aa  95.5  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  37.77 
 
 
249 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  34.17 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  29.46 
 
 
265 aa  93.2  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  34.57 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  37.01 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  30.15 
 
 
252 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  31.09 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  29.46 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  36.59 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  37.4 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  30.83 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  38.43 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  23.75 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  27.69 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  36.21 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  36.21 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  36.21 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  29.08 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3013  hypothetical protein  27.54 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131671  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  33.87 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  37.77 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0131  hypothetical protein  25.81 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  36.65 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  26.8 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>