282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3100 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  473  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  64.92 
 
 		 247 aa  285  4e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  39.92 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  43.87 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  41.8 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  41.6 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  42.55 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  37.7 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  40.4 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  36 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  41.15 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  40.74 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  40.33 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  40.74 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  38 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  36.78 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  37.45 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  37.04 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  34 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  37.01 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  36.6 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  38.93 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  40.8 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  37.29 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  35.95 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  37.3 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  36.6 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  40.73 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  40.73 
 
 		 258 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  38.71 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  35.46 
 
 		 276 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  44.17 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  38.31 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  34.57 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  35.51 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  39.34 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  41.67 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  35.98 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  42.32 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  39.08 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  35.65 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  35.65 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  37.02 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  33.61 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  32.52 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  35.86 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  34.39 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  34.39 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  35.6 
 
 		 251 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  34.96 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  34.68 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  40.65 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  41.7 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  37.66 
 
 		 253 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  40.64 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  39.83 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  41.3 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  41.41 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  31.47 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  33.19 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  34.44 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  37.97 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  41.41 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  36.75 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  36.75 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  31.42 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  37.45 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  36.67 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  40.34 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  37.44 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  32.02 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  35.81 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  27.92 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  32.49 
 
 		 306 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  28.69 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  32.79 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  35.83 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3595  permease-like protein  44.17 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487773  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  32.02 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  36.17 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  36.17 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  35.42 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  29.69 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  25.82 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  35.83 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  34.55 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  35.8 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  28.91 
 
 		 281 aa  92.8  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  40.57 
 
 		 257 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  29.48 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  25.6 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  30.83 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  33.05 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  42.62 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>