262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0458 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  63.31 
 
 		 252 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  53.22 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  53.22 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  56.15 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  56.9 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  39.92 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  41.15 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  40.25 
 
 		 251 aa  152  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  40.68 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  39.83 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  40.51 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  42.98 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  33.6 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  36.73 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  33.46 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  36.07 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  36.07 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  36.07 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  35.92 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  35.43 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  38.63 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  36.22 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  38.56 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  39.04 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  38.14 
 
 		 247 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  37.55 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  33.46 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  35.44 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  38.49 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  34.8 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  39.13 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  33.99 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  34.98 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  42.55 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  39.44 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  33.99 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  38.52 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  32.41 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  38.03 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  33.2 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  40.73 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  32.52 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  40.16 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  30.89 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  38.52 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  38.59 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  38.59 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  30.13 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  35.22 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  39.75 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  38.59 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  39.75 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  40.26 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  32.91 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  31.37 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  31.71 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  31.71 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  32.79 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  32.22 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  36.51 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  31.71 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  30.68 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  31.89 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  36.71 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  34.2 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  32.8 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  36.69 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  29.88 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  35.06 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  27.56 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  32.22 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  34.92 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  31.23 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  26.09 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  36.84 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  41.62 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  42.28 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  32.13 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  31.03 
 
 		 259 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  34.69 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  40.57 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  28.62 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  40.74 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  29.81 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  37.85 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  35.34 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  33.74 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  36.21 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  33.77 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  39.75 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  28.7 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  23.63 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>