250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5380 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  99.18 
 
 
245 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  99.18 
 
 
245 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  92.65 
 
 
245 aa  387  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  92.24 
 
 
245 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  89.39 
 
 
245 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  89.39 
 
 
245 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  87.35 
 
 
245 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  86.53 
 
 
245 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  76.73 
 
 
246 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  64.52 
 
 
247 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  63.01 
 
 
247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2380  protein of unknown function DUF81  57.94 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2785  protein of unknown function DUF81  57.08 
 
 
255 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2517  hypothetical protein  60.19 
 
 
255 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11302  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  45.38 
 
 
253 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  37.65 
 
 
251 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  37.02 
 
 
251 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  37.02 
 
 
251 aa  141  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  35.08 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  35.08 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  47.66 
 
 
250 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  37.45 
 
 
251 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  34.68 
 
 
252 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  35.08 
 
 
252 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  34.68 
 
 
252 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  43.9 
 
 
252 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  37.96 
 
 
251 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  37.61 
 
 
264 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  38.72 
 
 
252 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  38.72 
 
 
252 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  40.98 
 
 
252 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  42.36 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  41.59 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  42.04 
 
 
247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  39.29 
 
 
254 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  39.83 
 
 
249 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  40.1 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  37.18 
 
 
248 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  36.63 
 
 
246 aa  118  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  34.43 
 
 
276 aa  118  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  36.76 
 
 
259 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 
260 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  35.25 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  35.83 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  35.63 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  36.73 
 
 
253 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  35.22 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  33.07 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  32.4 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  38.36 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  40.33 
 
 
258 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  40.33 
 
 
258 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  38.87 
 
 
249 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  34.68 
 
 
251 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  36.89 
 
 
258 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  34.66 
 
 
247 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  35.54 
 
 
255 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  28.4 
 
 
262 aa  102  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  38.63 
 
 
249 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  32.24 
 
 
251 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  31.05 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  31.35 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  32.52 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  28.4 
 
 
261 aa  95.5  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  30.97 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  39.76 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  34.53 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
255 aa  89  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  34.04 
 
 
249 aa  89  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  35.92 
 
 
246 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  36.93 
 
 
256 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  37.74 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  32.13 
 
 
256 aa  85.1  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  28.45 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  35.6 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  30 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  32.43 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  28.35 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  28.81 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  33.97 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  29.32 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  27.16 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  26.29 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  26.84 
 
 
261 aa  79  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  37.72 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  37.72 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  36.8 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  34.81 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  28.85 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  30.42 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  31.33 
 
 
260 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>