171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0948 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0948  permease  100 
 
 
292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  35.42 
 
 
253 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  33.45 
 
 
251 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  35.19 
 
 
255 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  34.44 
 
 
254 aa  135  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  30.94 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  30.94 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  31.27 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  35.38 
 
 
248 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  31.01 
 
 
262 aa  125  9e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  31.16 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  30.3 
 
 
253 aa  119  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  34.15 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  30.6 
 
 
281 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  27.97 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  33.45 
 
 
255 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 
247 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  31 
 
 
253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  25.81 
 
 
261 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  31.43 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  30.71 
 
 
260 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  31.87 
 
 
258 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  28.18 
 
 
256 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  32.96 
 
 
283 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  29.15 
 
 
276 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  29.29 
 
 
262 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  29.39 
 
 
260 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  29.1 
 
 
251 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  30.21 
 
 
253 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  28.06 
 
 
269 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  31.27 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  27.02 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  30.45 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  30.22 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  35.11 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  35.11 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  35.11 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  30.5 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  30.23 
 
 
259 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
276 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  27.24 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  28.21 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  30.29 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  35.09 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  27.82 
 
 
251 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  26.89 
 
 
239 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  47.37 
 
 
256 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  29.51 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  26.72 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  27.27 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  34.44 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  26.95 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  26.69 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  26.47 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  28.06 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  29.37 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  27.64 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  30.08 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  25.76 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  30.28 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  27.05 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  27.21 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  26.33 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  28.47 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  28.47 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  31.36 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  25.98 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  25.62 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  24.06 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  25.09 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  24.06 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  26.14 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  28.51 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  26.16 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  30.73 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  26.94 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  37.14 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  22.87 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  31.82 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  27 
 
 
252 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  30.23 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  23.9 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  30.47 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  26.1 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  25.61 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  29.09 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  26.74 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  19.41 
 
 
245 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  24.63 
 
 
261 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  29.08 
 
 
245 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  29.08 
 
 
245 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>