272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1368 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
247 aa  460  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  51.97 
 
 
255 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  48.21 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  50.8 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  34.65 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  40.56 
 
 
253 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  39.91 
 
 
251 aa  141  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  39.76 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  47.83 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  47.83 
 
 
269 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  47.83 
 
 
277 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  41.06 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  33.48 
 
 
253 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  38.08 
 
 
271 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  39.32 
 
 
248 aa  125  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  36.86 
 
 
260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  36.86 
 
 
260 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 
252 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  35.11 
 
 
251 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  37.55 
 
 
276 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  35.59 
 
 
261 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  36.8 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  37.76 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  36.93 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  36.29 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  33.58 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  36.91 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  36.55 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  32.14 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  35 
 
 
252 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  36.93 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  36.67 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  32.23 
 
 
261 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  34.25 
 
 
262 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  34.88 
 
 
260 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  36.9 
 
 
251 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  33.47 
 
 
251 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  34.63 
 
 
260 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  33.46 
 
 
281 aa  102  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 
253 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  43.67 
 
 
245 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  31.6 
 
 
251 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  36.29 
 
 
259 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  31.23 
 
 
256 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  30.59 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  35.6 
 
 
276 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  34.16 
 
 
261 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  33.73 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  33.73 
 
 
260 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  35.32 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  38.98 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  32.02 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  32.02 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  35.68 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  32.13 
 
 
246 aa  89  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  37.91 
 
 
255 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  32.55 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  36.13 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  36.13 
 
 
258 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  33.77 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  35.27 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  33.47 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  29.55 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  38.32 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  32.47 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  36.48 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  33.47 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  29.6 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  34.44 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  29.48 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  29.08 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  29.48 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  38.55 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  29.48 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  29.48 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  31.08 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  29.05 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  27.9 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  37.15 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  25 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  27.2 
 
 
256 aa  72  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  27.19 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  28.07 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  26.92 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  26.36 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  26.78 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  26.78 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  26.78 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  26.78 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  26.78 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  36.25 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  26.36 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  28.91 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  27.39 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  38.59 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  29.32 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  35.66 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>