209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05670 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  100 
 
 
256 aa  477  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  44.62 
 
 
251 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  35.69 
 
 
252 aa  167  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  42.97 
 
 
256 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  44.58 
 
 
248 aa  155  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  39.84 
 
 
260 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  38.4 
 
 
271 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  39.84 
 
 
260 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  41.38 
 
 
281 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  41.9 
 
 
254 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  38.76 
 
 
262 aa  151  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  40.89 
 
 
249 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  43.21 
 
 
258 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  36.86 
 
 
261 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  38.19 
 
 
260 aa  141  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  39.59 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  33.98 
 
 
262 aa  139  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  39.68 
 
 
260 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  37.5 
 
 
276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  43.62 
 
 
259 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  40.48 
 
 
260 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  40.17 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  36.22 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  38.34 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  36.96 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 
247 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  36.82 
 
 
264 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  35.43 
 
 
248 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 
247 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  31.02 
 
 
256 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.34 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  43.14 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  38.72 
 
 
259 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  30 
 
 
256 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  34.75 
 
 
248 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  35.89 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  40.84 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  32.39 
 
 
247 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  30.43 
 
 
251 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  37.6 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  36.92 
 
 
269 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  38.7 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  34.75 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  31.75 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  32.81 
 
 
292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  30.16 
 
 
261 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  33.07 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 
253 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  29.96 
 
 
253 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  32.2 
 
 
260 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  33.59 
 
 
252 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  32.42 
 
 
252 aa  105  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  32.42 
 
 
252 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  32.81 
 
 
252 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  32.81 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  40.33 
 
 
247 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  35.83 
 
 
252 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  35.98 
 
 
252 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  35.97 
 
 
276 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  37.74 
 
 
250 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  35.21 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  31.44 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  35.42 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  34.14 
 
 
306 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  30.59 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  39.89 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  36.63 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 
246 aa  95.5  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  34.43 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  34.15 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  30.74 
 
 
251 aa  92  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  30.58 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  29.6 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  30.29 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  38.17 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  24.51 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  32.16 
 
 
254 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  31.17 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  34.73 
 
 
258 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  32.28 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  38.75 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  32.86 
 
 
249 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  36.32 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  34.1 
 
 
233 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  38.68 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  35.71 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  35.32 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3908  hypothetical protein  29.84 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000656929  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  31.97 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  28.34 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  38.02 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  34.54 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  25.89 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  26.01 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  35.17 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  34.39 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  34.39 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>