247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3069 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
255 aa  465  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  58.04 
 
 
253 aa  245  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  57.2 
 
 
247 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1787  hypothetical protein  60.32 
 
 
277 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1806  hypothetical protein  60.32 
 
 
269 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0832257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1853  hypothetical protein  60.32 
 
 
277 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.195293  normal  0.245781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  58.4 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  41.77 
 
 
262 aa  176  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  53.85 
 
 
247 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  37.6 
 
 
253 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  47.39 
 
 
248 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  42.69 
 
 
253 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  40.98 
 
 
251 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  42.57 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1957  transport protein  48.78 
 
 
245 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.450425  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  47.08 
 
 
258 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  43.16 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  41.7 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  41.42 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  41.39 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  35.74 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0948  permease  34.3 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  40.74 
 
 
271 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  38.22 
 
 
251 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  35.38 
 
 
264 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  30.12 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  31.27 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  36.32 
 
 
276 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  36.51 
 
 
260 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  36.51 
 
 
260 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  34.57 
 
 
261 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  36.73 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  32.31 
 
 
262 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  32.81 
 
 
269 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  31.75 
 
 
251 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  32.34 
 
 
251 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  39.53 
 
 
251 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  37.83 
 
 
247 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  37.66 
 
 
247 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  34.58 
 
 
252 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  34.58 
 
 
252 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  37.97 
 
 
248 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  35.89 
 
 
248 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  36.8 
 
 
281 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 
260 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.44 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  34.35 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  40.37 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  34.02 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  36.69 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  34.15 
 
 
261 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  28.97 
 
 
265 aa  94  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  35.48 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  34.9 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  34.04 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  33.73 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  37.2 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  27.84 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  32.93 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  31.33 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  35.6 
 
 
251 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  32.93 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  32.53 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  32.99 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  35.06 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  35.63 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  37.2 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  32.7 
 
 
259 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  38.28 
 
 
252 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  31.35 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  28.29 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  30.96 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  35.86 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  35.44 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13570  predicted permease  36.28 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.797263  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  35.02 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05670  predicted permease  43.14 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.268655  normal  0.509596 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  37.39 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  27.24 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  36.22 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  25.3 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  36.44 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  34.36 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  30.65 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  30.65 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  33.98 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  30.65 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  32.66 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  36.51 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  32.66 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  26.77 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  28.23 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>