229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2333 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  98.41 
 
 		 251 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  96.81 
 
 		 251 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  93.23 
 
 		 251 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  78.17 
 
 		 252 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  78.17 
 
 		 252 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  78.17 
 
 		 252 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  77.38 
 
 		 252 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  76.59 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  53.6 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  50.4 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  47.6 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  50.62 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  50.62 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  50.61 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  48.73 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  50.64 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  36.25 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  39.84 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  37.25 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  38.82 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  38.27 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  36.36 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  37.13 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  35.22 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  35.22 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  40.55 
 
 		 265 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  34.02 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  34.01 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  42.74 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  37.55 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  36.36 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  43.62 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  34.01 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  41.15 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  36.99 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  36.25 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  37.6 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  52.46 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  34.54 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 		 271 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  40.66 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  35.08 
 
 		 258 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  52.7 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  34.44 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4927  hypothetical protein  39.11 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3236  hypothetical protein  39.11 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4855  hypothetical protein  38.87 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489891  normal  0.0140803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4338  hypothetical protein  38.06 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183177  hitchhiker  0.00201476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  32.92 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  36.65 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  37.85 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  33.05 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  51.45 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  34.85 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  30.74 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  34.29 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5380  hypothetical protein  38.06 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  39.83 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3460  hypothetical protein  37.65 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.822074  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4906  hypothetical protein  37.65 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.690846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  30.2 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0791  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906806  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  37.38 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  32.94 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  37.98 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  30.56 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  39.83 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  35.34 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  39.67 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1450  hypothetical protein  36.29 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  31.8 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  29.37 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  32.63 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  32.66 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  32.66 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  31.5 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  30.95 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3707  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.161758  normal  0.928734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  29.69 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  33.73 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  32.79 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  34.63 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  37.1 
 
 		 247 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  34.44 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2785  protein of unknown function DUF81  39 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08910  predicted permease  27.09 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2380  protein of unknown function DUF81  38.17 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  37.83 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  37.83 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1660  hypothetical protein  29.02 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>