65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3271 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3271  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0526049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3491  hypothetical protein  87.14 
 
 
311 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444679  normal  0.159147 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2941  hypothetical protein  78.93 
 
 
312 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2970  hypothetical protein  78.93 
 
 
312 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.600048  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2926  hypothetical protein  78.93 
 
 
312 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2634  protein of unknown function DUF81  53.17 
 
 
301 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23150  predicted permease  54.64 
 
 
303 aa  269  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312312  normal  0.109239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1272  protein of unknown function DUF81  54.71 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1694  hypothetical protein  51.14 
 
 
307 aa  251  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.816106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3380  hypothetical protein  56.41 
 
 
320 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4359  protein of unknown function DUF81  50.79 
 
 
319 aa  248  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.649627  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3369  hypothetical protein  53.09 
 
 
315 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5210  hypothetical protein  62.34 
 
 
312 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326814  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2244  protein of unknown function DUF81  51.66 
 
 
317 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3441  protein of unknown function DUF81  52.78 
 
 
324 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133111  hitchhiker  0.00331884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1814  protein of unknown function DUF81  48.07 
 
 
294 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000014228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2481  protein of unknown function DUF81  49.29 
 
 
288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3033  protein of unknown function DUF81  52.96 
 
 
319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2859  hypothetical protein  50.19 
 
 
399 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480703  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2348  hypothetical protein  49.49 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3074  hypothetical protein  50.19 
 
 
300 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.195883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2791  hypothetical protein  49.81 
 
 
399 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3067  hypothetical protein  49.81 
 
 
369 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3083  hypothetical protein  50.58 
 
 
300 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2179  hypothetical protein  50.19 
 
 
336 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2831  hypothetical protein  50.19 
 
 
300 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3099  hypothetical protein  49.81 
 
 
300 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000490285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2049  hypothetical protein  51.39 
 
 
299 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.137237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2854  hypothetical protein  49.81 
 
 
300 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0100093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3102  hypothetical protein  49.81 
 
 
300 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3155  hypothetical protein  52.92 
 
 
321 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.176196  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4933  protein of unknown function DUF81  49.35 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2806  protein of unknown function DUF81  48.05 
 
 
295 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3779  hypothetical protein  47.67 
 
 
298 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4420  hypothetical protein  48.18 
 
 
298 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2187  hypothetical protein  43.3 
 
 
299 aa  202  8e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0356  hypothetical protein  43.03 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.522095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0983  hypothetical protein  41.73 
 
 
246 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3143  hypothetical protein  46.4 
 
 
255 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  46.59 
 
 
262 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  44.22 
 
 
243 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2466  protein of unknown function DUF81  43.93 
 
 
293 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0706848  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  42.63 
 
 
243 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66420  hypothetical protein  43.09 
 
 
239 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5363  hypothetical protein  46.61 
 
 
257 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.185372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45130  hypothetical protein  44.4 
 
 
325 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5761  hypothetical protein  42.74 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0200  ABC transporter, permease component  43.49 
 
 
364 aa  162  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3716  protein of unknown function DUF81  44.89 
 
 
253 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0548551  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0237  protein of unknown function DUF81  41.89 
 
 
335 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4414  protein of unknown function DUF81  45.53 
 
 
300 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2681  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1500  hypothetical protein  40.16 
 
 
295 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1700  protein of unknown function DUF81  37.6 
 
 
355 aa  148  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2611  protein of unknown function DUF81  37.25 
 
 
392 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0884997  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0408  hypothetical protein  45.97 
 
 
255 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0567  transmembrane protein  37.6 
 
 
338 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0855864  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2155  protein of unknown function DUF81  42.41 
 
 
312 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518324  normal  0.256339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  35.74 
 
 
498 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4044  hypothetical protein  45.93 
 
 
305 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0371784  normal  0.37815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1069  protein of unknown function DUF81  37.04 
 
 
250 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4526  protein of unknown function DUF81  47.34 
 
 
305 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.677617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  27.89 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  33.03 
 
 
119 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  25.95 
 
 
263 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>